Kurz danach, um 11:30 Uhr, ging das MS Mecklenburg dann auf seine Jungfernfahrt - gefahren wurde die Große Insellinie. Auf dieser Tour wird das neue Schiff hauptsächlich eingesetzt, später dann auch auf der Winterlinie. Ebenfalls kann das MS Mecklenburg auch für Charterfahrten gebucht werden.
Wegen dem Sonnendach ist eine Fahrt in den Ziegelsee (Ziegelinnen- und auch Ziegelaussensee) nicht möglich. Für die Durchfahrt des Werderkanals, mit der Brückenunterquerung, ist das Schiff zu hoch.